تعد بوائك المسجد الأقصى من المعالم العمرانية المميزة التي تقع ضمن ساحات المسجد، والبائكة هي مجموعة الأعمدة المتتابعة على خط مستقيم، والموصولة في أعلاها بأقواس تحمل السقف. تقوم البوائك حول صحن قبة الصخرة المشرفة من جهاتها الأربع، ويصعد من خلالها إلى صحن الصخرة بواسطة درج عريض.

منذ أيامه الأولى، والمسجد الأقصى يحتضن حركة علمية نشطة تمثلت في تعليم القرآن الكريم والحديث والفقه الإسلامي، غير أن هذا النشاط أخذ بعدا أكثر تنظيما بظهور مصطلح المدرسة كمؤسسة تعليمية تضمن الاستمرارية، وقد كثرت الروايات التي أشارت إلى انتشار المدارس في رحاب الأقصى، مما يدلل على مكانته ودوره في نشر العلوم الإسلامية وصيانتها. ويرتبط انتشار المدارس في الأقصى بالفترة الأيوبية، وقد ازدهر خلال الفترة المملوكية، كما حافظت الحركة العلمية على نشاطها خلال فترة الحكم العثماني. 

المئذنة بناء عال يصعد عليه المؤذن لرفع الأذان والنداء للصلاة، وهي من العناصر المعمارية البارزة التي أضيفت إلى المسجد الأقصى في العهد المملوكي، وقد سميت باسم من بناها أو نسبة لأبواب المسجد التي تقع بقربها، ويبلغ عددها أربع مآذن بديعة الصنعة جميلة العمارة، توزعت على الجهتين الغربية (3 مآذن) والشمالية (مئذنة واحدة).

يقع المسجد الأقصى المبارك في الزاوية الجنوبية الشرقية من مدينة القدس المسورة التي تسمى اليوم (البلدة القديمة)، والأقصى اسم لكل ما دار حوله السور،  ويشمل جميع المصليات التي بداخله مثل الجامع القبلي (الواقع في الجهة الجنوبية) وقبة الصخرة (الواقعة في مركز المسجد) بالإضافة إلى نحو 200 معلم ومبنى تقع ضمن حدوده

يعد السبيل من وسائل توفير المياه داخل المسجد الأقصى، وهو عبارة عن موضع للشرب والوضوء، ووجود عدد من الأسبلة بلغت 14 سبيلا داخل الأقصى دليل على اهتمام المسلمين بتوفير المياه للمصلين والطلاب في المسجد، وبدراسة هذه الأسبلة نجد أنها قد شيدت في الفترات الأيوبية والمملوكية والعثمانية على التوالي.